Ιολογία

Επιστημονικές Δημοσιεύσεις Ανοικτής Πρόσβασης

Recovery of deleted deep sequencing data sheds more light on the early Wuhan SARS-CoV-2 epidemic
Jesse D Bloom
bioRxiv 2021.06.18.449051; doi: https://doi.org/10.1101/2021.06.18.449051
Εντοπίζεται ένα σύνολο δεδομένων που περιέχει αλληλουχίες του ιού SARS-CoV-2 από την αρχή της επιδημίας στη Wuhan, το οποίο έχει διαγραφεί από το αρχείο NIH's Sequence Read Archive. Τα διαγραμμένα αρχεία ανακτώνται από το Google Cloud και ανακατασκευάζονται μερικές σειρές 13 πρώιμων επιδημικών ιών.
Manring, Noel; Ahmed, Muzammil M N; Tenhoff, Nicholas; Smeltz, Jessica L; Pathirathna, Pavithra.
Anal Chem ; 94(20): 7149-7157, 2022, https://doi.org/10.1021/acs.analchem.1c05358
Publication Date:May 10, 2022
Η τελευταία πανδημία του κορωνοϊού έχει αναδείξει τους περιορισμούς των σύγχρονων συμβατικών μεθόδων ανίχνευσης ιών. Σε σύγκριση με τους μη ηλεκτροχημικούς αισθητήρες, οι ηλεκτροχημικοί αισθητήρες παρέχουν την ιδανική πλατφόρμα για γρήγορη, φθηνή, ευαίσθητη και επιλεκτική διάγνωση αρκετών ιών, ιδιαίτερα επιτόπου στα σημεία φροντίδας. Αυτό το άρθρο παρουσιάζει τις πιο ελπιδοφόρες μελέτες της τελευταίας δεκαετίας για την ανίχνευση ενός ευρέος φάσματος ιών χρησιμοποιώντας βολταμετρία, αμπερομετρία και φασματοσκοπία ηλεκτροχημικής εμπέδησης.
03 September 2020
Τα αποτελέσματα της δοκιμής 4 δείχνουν ότι μετά από έξι ημέρες καραντίνας υλικού βιβλιοθήκης σε στοίβα, ο ιός SARS-CoV-2 εντοπίστηκε στο σύνολο των υλικών που δοκιμάστηκαν: βιβλίο με σκληρό εξώφυλλο, βιβλίο με μαλακό εξώφυλλο, βιβλίο με πλαστικό προστατευτικό κάλυμμα και θήκη DVD. Σε σύγκριση με το τεστ 1, το οποίο είχε ως αποτέλεσμα μη ανιχνεύσιμο ιό SARS-CoV-2 μετά από τρεις ημέρες καραντίνας στα 4 μη στοιβαγμένα υλικά, τα αποτελέσματα της δοκιμής 4 επισημαίνουν την επίδραση της στοίβαξης και την ικανότητά της να παρατείνει την επιβίωση του ιού SARS-CoV-2.
Rapid evolution of SARS-CoV-2 in domestic cats
Bashor, Laura; Gagne, Roderick B; Bosco-Lauth, Angela; Stenglein, Mark; VandeWoude, Sue
Virus Evol ; 8(2): veac092, 2022, https://doi.org/10.1093/ve/veac092
Published: 30 September 2022
Η μόλυνση από SARS-CoV-2 (SARS2) ενός νέου ανεκτικού είδους ξενιστή μπορεί να οδηγήσει σε ταχεία εξέλιξη του ιού. Τα δεδομένα υποδεικνύουν ότι τα αιλουροειδή είναι πολύ ευαίσθητα στη μόλυνση από SARS2 και μπορεί να συμβεί προσαρμογή συγκεκριμένη για το είδος μετά από μετάδοση από άνθρωπο σε ζώο. Στην παρούσα μελέτη πραγματοποιήθηκε πειραματική μόλυνση και ανάλυση των δημόσια διαθέσιμων αλληλουχιών SARS2 για να παρατηρηθεί η εμφάνιση και η επιλογή παραλλαγών σε οικόσιτες γάτες.
Quantitative measurement of infectious virus in SARS-CoV-2 Alpha, Delta and Epsilon variants reveals higher infectivity (viral titer:RNA ratio) in clinical samples containing the Delta and Epsilon variants.
Hannah W Despres, Margaret G Mills, et al.
medRxiv 2021.09.07.21263229; doi: https://doi.org/10.1101/2021.09.07.21263229
Posted September 20, 2021.
Η μέτρηση της σχέσης μεταξύ ζωντανού ιού και ιικού RNA είναι ένα σημαντικό βήμα στην εκτίμηση της μολυσματικότητας των νέων παραλλαγών του SARS-CoV-2.
David Cyranoski
Nature 581, 22-26 (2020), doi: 10.1038/d41586-020-01315-7
04 MAY 2020
Οι επιστήμονες συγκεντρώνουν στοιχεία για να συνθέσουν την εικόνα του πώς λειτουργεί το SARS-CoV-2, από πού προήλθε και ποια θα μπορούσε είναι η συνέχεια - ωστόσο παραμένουν οι πιεστικές ερωτήσεις σχετικά με την πηγή του COVID-19.
Predictions of the SARS-CoV-2 Omicron Variant (B.1.1.529) Spike Protein Receptor-Binding Domain Structure and Neutralizing Antibody Interactions
Colby T Ford, Denis Jacob Machado, Daniel A Janies
bioRxiv 2021.12.03.471024; doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.03.471024
Posted December 06, 2021
Σε αυτή τη μελέτη, προβλέπονται κάποιες δομικές αλλαγές που αφορούν στη δέσμευση του υποδοχέα και που ενδέχεται να μειώσουν την αλληλεπίδραση των εξουδετερωτικών αντισωμάτων και επομένως την αποτελεσματικότητα των τρεχόντων εμβολίων.
Science, doi: 10.1126/science.acx9721
27 NOV 2021
Οι εργαστηριακές δοκιμές και τα πρότυπα εξάπλωσης θα δείξουν εάν οι πολλές μεταλλάξεις της νέας παραλλαγής του SARS-CoV-2 αποτελούν σοβαρή απειλή
Pandemic enters transition phase—but to what?
KAI KUPFERSCHMIDT
SCIENCE, Vol 374, Issue 6564, pp. 135-136, DOI: 10.1126/science.acx9290
8 Oct 2021
Μέχρι στιγμής, ο SARS-CoV-2 έχει εξελιχθεί περίπου πέντε φορές πιο γρήγορα από τον H3N2, έναν από τους τρεις τύπους ιού γρίπης που προσβάλουν τους ανθρώπους. Αυτό το ποσοστό είναι πιθανό να επιβραδυνθεί με την πάροδο του χρόνου σε κάτι συγκρίσιμο με τη γρίπη.

Δημοσιεύσεις Ελλήνων Ερευνητών

Pages