Ο Νίκος Παπουτσιδάκης ξεκίνησε ως φοιτητής της Ιατρικής Σχολής Αθηνών το 1999, από όπου και αποφοίτησε το 2005. Έλαβε το διδακτορικό του από την Ιατρική Σχολή Αθηνών το 2011. Επαγγελματικά, μετά την ολοκλήρωση της στρατιωτικής του θητείας, εργάστηκε ως αγροτικός ιατρός στο νομό Ρεθύμνου και συνέχισε ως ειδικευόμενος ιατρός στα νοσοκομεία Ρεθύμνου και Αθηνών (Γ.Ν. «Γ. Γεννηματάς»), από όπου και έλαβε την ειδικότητα της Καρδιολογίας το 2015. Το 2016 μετέβη στις ΗΠΑ όπου ξεκίνησε να εργάζεται ως Associate Research Scientist στο τμήμα καρδιακής ανεπάρκειας και κληρονομούμενων μυοκαρδιοπαθειών της Ιατρικής Σχολής του Πανεπιστημίου του Yale. Το 2018 έγινε Λέκτορας Ιατρικής [Instructor of Medicine (Cardiology)] στο Yale. Παρέμεινε στις ΗΠΑ έως τον Φεβρουάριο του 2020, οπότε και επέστρεψε για να εργαστεί στην AstraZeneca Ελλάδος ως Medical Affairs Manager.
Το ιατρικό γνωστικό του αντικείμενο περιλαμβάνει την πρόληψη, διάγνωση και αντιμετώπιση της καρδιακής ανεπάρκειας και κληρονομούμενων μυοκαρδιοπαθειών. Παράλληλα, έχει συμμετάσχει στο σχεδιασμό και την εκτέλεση πολυάριθμων κλινικών μελετών και ερευνητικών εργασιών. Στην τωρινή του εργασία στη φαρμακευτική βιομηχανία προσφέρει την επιστημονική και κλινική του εμπειρία στο σχεδιασμό και υλοποίηση στρατηγικών στόχων σε μια από τις πολυεθνικές εταιρείες του χώρου.